我有一段代码，经过一些计算后会抛出“细分错误”。 我一直在寻找有效的内存管理方面的帮助。 我的程序执行以下操作： 我有一个最小的网格。 i，j，k坐标-52，-34，-35和最大i，j，k坐标53、37、33。（在i，j，k循环中）。 我想将每个网格点与具有约2000行x，y，z位置的* .pdb文件进行比较。 原子1756 OH2 TIP3W2710 -46.420 0.150 2.420 原子1757 OH2 TIP3W2753 19.800 2.170 -14.550 原子1758 OH2 TIP3W2754 18.150 20.090 12.270
因此，基本上在程序的主体中，我在compare（）函数中将每个唯一的i，j，k值与每个x，y，z进行比较。 问题是程序经过1000个i，j，k值，然后给出分段错误。 继承程序：
#include<stdio.h>
#include<stdlib.h>
#include<math.h>
main()
{
FILE *fp1;
float i, j, k;
int val;
fp1 = fopen("output.dat", "w");
for (i=-52; i <53; i++)
{
for(j=-34; j <37; j++)
{
for (k=-35; k <33; k++)
{
val= compare (i,j,k);
if (val>=1)
{
fprintf(fp1, "%f\t %f\t %f\t %d\n", i,j,k, val);
}
}
}
}
fclose(fp1);
}
compare (p,q,r)
float p,q,r ;
{
char cbuff[100];
char sx[7];
char sy[7];
char sz[7];
float a[2500];
float b[2500];
float c[2500];
float dist, num;
int count=0, i=0, j;
FILE *fp2;
fp2 = fopen("test1.pdb", "r");
while (fgets (cbuff, 80, fp2)!= NULL)
{
if (cbuff[0] =='A' && cbuff[1] == 'T' && cbuff[2] == 'O' && cbuff[3] == 'M')
{
strncpy (sx, cbuff+31, 7);
sx[7] = '\0';
strncpy (sy, cbuff+40, 7);
sy[7] = '\0';
strncpy (sz, cbuff+47, 7);
sz[7] = '\0';
a[i] = atof(sx);
b[i] = atof(sy);
c[i] = atof(sz);
/*printf("%d\t%f\t%f\t%f\n", i, a[i], b[i], c[i]);*/
i++;
}
}
for(i=0; i < 2013; i++)
{
num = (pow ((c[i]-r),2) + pow ((b[i]-q),2) + pow((a[i]-p),2));
dist = sqrt (num);
if (dist < 1 )
{
count++;
printf("%f\n", dist);
}
}
return(count);
fclose(fp2);
}
伙计们，您正在调用一个* LOT *的compare（）函数，该函数分配了* LOT *的内存...只需一次将函数外部的所有这些缓冲区全部声明一次，并在使用完后清理每个缓冲区。
顺便说一句，您调用return，然后关闭文件。按照这种顺序，该文件将永远不会关闭，因为当您调用return时，该函数将结束。
这里的要点是，在程序中绝对需要浮点数。没有浮点数就不能执行您的任务吗？如果仍然需要，可以安全地将整数传递给接受float的函数，编译器将负责向上转换。
嗯，如果您说没问题，我的意思是说数学，那么我建议改变毫无意义。虽然我个人会逐行解析它，然后将空格用作分隔符以分隔成令牌等。
无论如何，问题出在您的记忆中，正如您提到的那样。
In order for that to work you need to allocate about
100 x 60 x 60 = 360000on the stack. Is such a size legal.?Probably not. In that case you might need to dynamically increase the array on the fly using malloc.我并不真正使用“ c”这个词，也许别人经常可以帮助您。
那么还有什么选择呢？
我需要使用malloc动态增加数组的帮助。
我有一个代码，其中包含以下for循环：
问题是内存用完了，程序抛出了段错误。
程序有很多错误，解析数据的方式也很原始。如果atof是我想像的atoi之类的东西，那么它就是“让我们不要去那里”类型的函数。
让我想想。您能用简单的英语解释您想要做什么吗？
是否可以将整数转换为浮点数？我将for循环中的i，j，k作为浮点传递给执行一些数学运算的函数。
停止使用浮点变量作为for循环计数器，您应该一切顺利。
您能提出一些替代for循环的硬编码吗？我相信那是什么吞噬了记忆。如果我减少i，j和k的数量，该程序可以正常工作。
是的，它们是数学运算。我能够使用类型转换来获取浮点值。在for循环中将float值更改为int确实使我的程序正常工作。谢谢 ！
...并且如果您想避免将来遇到麻烦，请始终避免使用浮点数作为循环索引。
从那以后我以为会有人帮助您。同时阅读这些？
http://www.cplusplus.com/reference/clibrary/cstdlib/malloc.html
http://vergil.chemistry.gatech.edu/resources/programming/c-tutorial/dynamic.html
有很多选择。要找出问题出在哪里，请开始在每个部分之间放置一堆printf。顺便说一句，我没有做任何更改，只是对其进行了编辑，以便其他人可以阅读。
毫无疑问，您正在退出内存。像这样的硬编码东西的坏主意。