• 在R中的数据框范围内查找重叠

    我有两个bedfile作为R中的数据帧,我想为其映射所有重叠的区域(类似于最接近的bedtool能够执行的操作)。 BedA: chr start end 2 100 500 2 200 250 3 275 300 床B: chr start end 2 210 265 2 99 106 8 275 290 BedOut: chr st...
  • 将IRanges列表作为列包含在data.frame中

    我有一些这样的数据结构: x01 <- c("94633X94644Y95423X96130", "124240X124494Y124571X124714", "135654X135660Y136226X136786") 最后,我通过一些步骤将其用作IRanges对象: x02 <- sapply(x01, function(x) do.call(rbind, strsplit(strsplit(x, ...
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